随着数据质量的增加和建模方法的成熟,临床预测模型成为目前医学研究的热点之一。医疗保健决策通常基于风险或概率,而评估临床预测模型的性能对于确定其在预期使用人群和环境中的预测准确性至关重要。为帮助研究人员对模型的预测准确性做出可靠而公正的评价,顶级医学期刊BMJ在2023年底陆续发布了三篇临床预测模型评
顶级医学期刊BMJ在2023年底陆续发布了三篇临床预测模型评估指南,为研究人员开展临床预测模型研究提供了权威的参考资料。本系列推文的第1篇介绍了BMJ指南中几类模型内部验证的方法以及外部验证研究的意义。
临床预测模型系列方法自从被提出到火热已经有很长一段时间,这个时间可能可以追溯到新世纪之初。不过,随着机器学习和深度学习的火热,临床预测模型的方法学得到了很大的扩展,这也直接造就了最近几年的“群雄逐鹿”盛况。 今年以来,不少朋友有一种错觉:临床预测模型已经“落入凡尘”。从某种角度来说确实,毕竟火热这么
顶级医学期刊BMJ在2023年底陆续发布了三篇临床预测模型评估指南,为研究人员开展临床预测模型研究提供了权威的参考资料。本系列推文的前两篇围绕BMJ指南的内容详细介绍了模型内部验证和外部验证方法。而本推文是模型评估系列文章的最后一篇,将结合案例针对性地介绍如何计算外部验证所需的样本量。
乳头状甲状腺癌(PTC)是内分泌系统中最常见的恶性肿瘤,占所有甲状腺癌病例的80%以上。虽然随着体检的普及,PTC的检出率明显升高,但少数患者会出现远处转移(DM),总体预后显著恶化,10年生存率也从90%下降至40%。 因此,找到一种有效的 DM 风险早期预测方法,对于制定个体化诊疗计划和改善预后
剖宫产子宫瘢痕异位妊娠(CSEP)是剖宫产术后妊娠的一种潜在致命的并发症,可能导致孕妇大出血或死亡。手术中的出血量直接影响手术的成功率。 近年来,基于电子病历(EMR)数据构建的机器学习(ML)预测模型研究日益增多。本研究团队开发的最佳预测模型已被集成到一个网络应用程序中,使临床医生无需掌握R语言或编程技能即可预测CSEP患者的术中风险。 2024年12月,中国学者在医学顶级期刊Lancet子刊《eClinicalMedicine》(医学一区top,IF=9.6)发表了一篇题为:“Risk of intraoperative hemorrhage during cesarean scar ectopic pregnancy surgery: development and validation of an interpretable machine learning prediction model”的研究论文。 在该项研究中,研究团队使用四种方法确定模型的预测因子,并使用八种机器学习法构建预测模型。不同于我们之前介绍的SHAP法,本研究使用"iBreakDown"包对模型进行可视化。
在该项研究中,研究团队使用了去身份化电子健康记录(EHR)数据,纳入老年患者。 本研究旨在基于8种机器学习法和SHAP法,构建可解释机器学习预测模型,以评估风险因素并预测老年心合并高血压患者的住院死亡率。 √缺失数据的处理 研究中所有变量的缺失数据比例均保持在30%以下,使用K-最近邻(KNN)分类算法对缺失数据进行处理。 √变量筛选 使用LASSO法在44个变量中筛选出9个最佳预测因子,包括年龄、住院时间(LOS)、中性粒细胞(Neu)、尿素、Cl、活化部分凝血活酶时间(APTT)、白细胞(LEU)、白蛋白和HDL胆固醇。
SHAP法作为一个强有力的工具,能帮助我们理解模型的输出,告诉我们每一个特征对预测结果的影响。 可以说,无论是复杂的深度学习模型,还是简单的回归模型,SHAP都能给出解释。 先前我们介绍了SHAP的理论背景,今天来上点干货,开启我们系列文章的第二篇:SHAP分析之可视化及其可视化图
就在11月13日,Web of Science 运营方科睿唯安(Clarivate)宣布,将不再赋予中科院一区期刊 eLife 影响因子。不过,该期刊的部分论文仍然会被 Web of Science 收录。 今天我们将分享一篇发表在该期刊的机器学习临床预测模型文章,我们先来看一下它的研究设计与分析过
众所周知,回归模型是构建临床预测模型的主力。事实上,过去十年里开发的用于预测肝纤维化的非侵入性的工具,大多都依赖于逻辑回归模型。 尽管机器学习方法功能强大,但研究者们无法准确把握哪种机器学习法性能最佳。这时,Super Learner便成为了一个有效的解决方案,它能
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